Santorini ilu on kahtlemata tähelepanu väärt.
Aga silmapaistev on see, läbi milliste raskuste on saar tänasesse päeva jõudnud.
Umbes 1630. aastani eKr oli Santoríni, mida kutsuti sel ajal Kallistiks, üks paljudest koonilistest vulkaanisaartest. Selle lõunakaldal asus Minose kultuuri aegne linn. Siis aga tabas saart erakordselt tugev vulkaanipurse, nii et varises kokku saare keskosa ja moodustus praegune hiidkraater. Kraatrisse tulvas merevesi ning merest küündis välja vaid sirbikujuline osa saarest. Maavärin vallandas aga hiidlaine, mis kiirendas Minose-aegse Kreeta hävingut.
Saar asustati hiljem uuesti ja sellele anti nimeks Thera, ent asukad seisid pidevalt silmitsi maavärinatega, mis tegid 1956. aastal maatasa suurema osa kahest peamisest linnast, Firást ja Oíast.